BİYOMÜHENDİSLİK (İNGİLİZCE, TEZLİ)
Yüksek Lisans	TYYÇ: 7. Düzey	QF-EHEA: 2. Düzey	EQF-LLL: 7. Düzey

Ders Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Yarıyıl	Teorik	Pratik	Kredi	AKTS
BNG5527	İleri İmmünoloji	Güz Bahar	0	0	3	6

Bu katalog bilgi amaçlıdır, dersin açılma durumu, ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir.

Temel Bilgiler

Öğretim Dili:	İngilizce
Dersin Türü:	Departmental Elective
Dersin Seviyesi:	LİSANSÜSTÜ
Dersin Veriliş Şekli:	Yüz yüze
Dersin Koordinatörü:	Dr. Öğr. Üyesi CANAN BAĞCI
Dersin Amacı:	Bu dersin sonunda öğrenciler: - Doğuştan gelen ve adaptif bağışıklık sistemleri dahil olmak üzere, bağışıklık yanıtlarının hücresel ve moleküler mekanizmalarını analiz edebilecektir. - Bağışıklık düzenlenmesi, tolerans ve bağışıklık kaçışı gibi konuları içeren güncel araştırmaları ve gelişmekte olan başlıkları eleştirel bir bakışla değerlendirebilecektir. - İmmüno-genetik, antijen sunumu, sitokin sinyal iletimi ve immünolojik bellek gibi ileri düzey bağışıklık kavramlarını anlayıp uygulayabilecektir. - Otoimmün hastalıklar, alerji, organ nakli, kanser ve enfeksiyon hastalıkları gibi durumların bağışıklık sistemi temellerini inceleyebilecektir. - İmmünolojik çalışmalardan elde edilen deneysel verileri yorumlayabilecek ve modern immünoloji tekniklerini kullanarak deney tasarlayabilecektir. - Aşı geliştirme, immünoterapi ve klinik tanı gibi konular bağlamında immünolojinin translasyonel (kliniğe uygulanan) yönlerini tartışabilecektir. - Bilimsel iletişim becerileri geliştirecek, immünoloji alanındaki birincil literatürü sunma ve eleştirme yetkinliği kazanacaktır.

Öğrenme Kazanımları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
- Doğuştan gelen ve adaptif bağışıklık sisteminin bileşenlerini hücresel ve moleküler düzeyde açıklayacak ve ayırt edebilecektir.
- İleri düzey immünoloji konularına ve güncel araştırmalara ait bilimsel literatürü eleştirel bir yaklaşımla analiz edip yorumlayabilecektir.
- Otoimmün hastalıklar, alerji, kanser ve enfeksiyonlar gibi bağışıklıkla ilişkili hastalıkların patogenezini temel immünoloji ilkeleriyle açıklayabilecektir.
- Flow sitometri, ELISA, immünohistokimya ve yeni nesil dizileme gibi modern teknikleri içeren bağışıklık sistemi deneyleri tasarlayacak ve verileri değerlendirebilecektir.
- Aşı geliştirme, immünoterapiler ve tanı araçları gibi klinik ve translasyonel immünoloji konularını tartışabilecek ve değerlendirebilecektir.
- Karmaşık immünolojik olgulara ilişkin bilimsel argümanları hem yazılı hem de sözlü biçimde sunacak ve savunabilecektir.
- Temel immünoloji bilgisini sentezleyerek, güncel araştırma sorularını ve klinik sorunları ele alabilecektir.

Dersin İçeriği

Bu ders, bağışıklık sisteminin hücresel ve moleküler düzeydeki işleyişini derinlemesine incelemektedir. Konular arasında doğuştan gelen ve kazanılmış bağışıklık, antijen tanıma, sinyal iletim yolları, sitokin ağları, immünolojik bellek ve tolerans mekanizmaları yer alır. Ayrıca, otoimmün hastalıklar, aşırı duyarlılık reaksiyonları, kanser ve enfeksiyon hastalıklarının immünopatogenezi ele alınır. Mukozal bağışıklık, immün kontrol noktaları ve sistem immünolojisi gibi güncel konular da tartışılır. Öğrenciler, güncel bilimsel literatür ve ileri deneysel tekniklerle çalışacak; aşı geliştirme, immünoterapi ve tanı yöntemleri gibi translasyonel uygulamalara odaklanacaktır.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta	Konu	Ön Hazırlık
1)	Giriş ve Genel Bakış - Bağışıklık sistemine giriş: doğuştan gelen vs. kazanılmış bağışıklık - İmmünolojinin tarihsel gelişimi ve kapsamı - Homeostaz, bağışıklık gözetimi ve immünopatoloji	Ders Notları
2)	Bağışıklık Sisteminin Hücreleri ve Organları - Hematopoez, lenfoid organlar - Dendritik hücreler, makrofajlar, T/B lenfositler, NK hücrelerinin rolleri - Lenfosit gelişimi ve dolaşımı	Ders Notları
3)	Doğuştan Gelen Bağışıklık: Tanıma ve Yanıt - PAMP'ler, PRR’ler, TLR’ler, NOD benzeri reseptörler - Enflamasyon, fagositoz, antiviral yanıtlar (interferonlar) - Doğuştan lenfoid hücreler (ILC'ler)	Ders Notları
4)	Antijen Tanıma ve MHC Sunumu - Antijen ve epitop yapısı, çeşitliliği - Majör Histouyumluluk Kompleksi (MHC) sınıf I ve II - Antijen işleme ve sunum yolları	Ders Notları
5)	Kazanılmış Bağışıklık I: B Hücreleri ve Antikor Yanıtı - B hücresi gelişimi ve aktivasyonu - İmmünoglobulin yapısı ve gen yeniden düzenlenmesi - İzotip değişimi, afinitenin artması ve hafıza B hücreleri	Ders Notları
6)	Kazanılmış Bağışıklık II: T Hücreleri ve Hücresel Yanıt - T hücresi gelişimi ve seçimi (pozitif/negatif) - TCR yapısı, MHC’ye bağımlılık - CD4+ T yardımcı alt grupları (Th1, Th2, Th17, Tfh, Treg), CD8+ sitotoksik T hücreleri	Ders Notları
7)	Sitokinler ve Bağışıklık Hücreleri Arası İletişim - Sitokin aileleri ve reseptörleri - Sitokin sinyalleme (JAK/STAT yolu) - Sitokin ağları ve bağışıklık düzenlenmesi	Ders Notları
8)	Bağışıklık Toleransı ve Düzenlenmesi - Merkezi ve periferik tolerans mekanizmaları - Düzenleyici T hücreleri, anergi, klonal eliminasyon - İmmün kontrol noktaları (CTLA-4, PD-1)	Ders Notları
9)	İmmünolojik Hafıza ve Aşılama - Hafıza T ve B hücrelerinin oluşumu - Aşılamanın prensipleri ve adjuvanlar - Başarılı aşı örnekleri ve yeni nesil teknolojiler (ör. mRNA aşıları)	Ders Notları
10)	İmmün Yetmezlikler - Primer (doğuştan) immün yetmezlikler - Sekonder (edinilmiş) immün yetmezlikler: HIV örneği - Tanı ve tedavi stratejileri	Ders Notları
11)	Aşırı Duyarlılık ve Otoimmünite - Tip I–IV aşırı duyarlılık reaksiyonları - Otoimmünite: öz-toleransın kaybı, genetik/çevresel faktörler - Örnekler: Tip 1 diyabet, SLE, romatoid artrit	Ders Notları
12)	Tümör İmmünolojisi ve Transplantasyon - Tümör immün gözetimi ve kaçış mekanizmaları - İmmünoterapiler (kontrol noktası inhibitörleri, CAR-T hücreler) - Organ nakli, GVHD, HLA eşleşmesi	Ders Notları
13)	Öğrenci Sunumları
14)	Öğrenci Sunumları

Kaynaklar

Ders Notları / Kitaplar:	Kenneth Murphy, Casey Weaver "Janeway's Immunobiology" 10th edition, Garland Science
Diğer Kaynaklar:

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl İçi Çalışmaları	Aktivite Sayısı	Katkı Payı
Ödev	14	% 30
Sunum	1	% 20
Ara Sınavlar	1	% 30
Final	1	% 20
Toplam		% 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI		% 80
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI		% 20
Toplam		% 100

AKTS / İş Yükü Tablosu

Aktiviteler	Aktivite Sayısı	Süre (Saat)	İş Yükü
Ders Saati	14	3	42
Sunum / Seminer	14	6	84
Ara Sınavlar	1	3	3
Final	14	2	28
Toplam İş Yükü			157

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

Etkisi Yok	1 En Düşük	2 Düşük	3 Orta	4 Yüksek	5 En Yüksek

	Dersin Program Kazanımlarına Etkisi	Katkı Payı
1)	Bilimsel literatürü takip eder, eleştirel biçimde analiz eder ve mühendislik problemlerinin çözümünde etkin biçimde kullanır.
2)	Biyomühendislik alanıyla ilgili özgün projeler tasarlar, planlar, uygular ve yönetir.
3)	Biyomühendislik ile ilgili çalışmaları bağımsız olarak yürütür, bilimsel sorumluluk alır ve elde edilen sonuçları eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirir.
4)	Yaptığı araştırma ve projelerin sonuçlarını akademik standartlara uygun biçimde yazılı, sözlü ve görsel olarak etkili bir şekilde sunar.
5)	Alanıyla ilgili uzmanlık gerektiren konularda bağımsız araştırma yapar, özgün düşünce geliştirir ve bu bilgileri uygulamaya aktarır.
6)	Biyomühendislik alanına özgü ileri düzey kuramsal ve uygulamalı bilgileri etkin bir biçimde kullanır.
7)	Mesleki, bilimsel ve etik değerlere uygun hareket eder; biyomühendislik uygulamalarının toplumsal, çevresel ve etik etkilerini gözeterek sorumluluk alır.