ECZACILIK
Lisans	TYYÇ: 6. Düzey	QF-EHEA: 1. Düzey	EQF-LLL: 6. Düzey

Ders Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Yarıyıl	Teorik	Pratik	Kredi	AKTS
MBG2004	Biyolojik Bilimler için Hesaplama II	Bahar	2	2	3	7

Bu katalog bilgi amaçlıdır, dersin açılma durumu, ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir.

Temel Bilgiler

Öğretim Dili:	İngilizce
Dersin Türü:	Non-Departmental Elective
Dersin Seviyesi:	LİSANS
Dersin Veriliş Şekli:	Yüz yüze
Dersin Koordinatörü:	Dr. Öğr. Üyesi ELIZABETH HEMOND
Dersi Veren(ler):	Prof. Dr. SÜREYYA AKYÜZ
Dersin Amacı:	Bu ders biyoloji için kullanılan bilişimsel araçlar hakkında ileri düzeyde bilgi vermeyi amaçlar.

Öğrenme Kazanımları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
1. Önemli biyolojik data veri kaynaklarını öğrenir.
2. Biyolojik analizler sonucunda elde edilen verilerin istatistiki, matematiksel değerlendirmesini yapar.
3. Genom dizileme verileri üzerinde çeşitli araçları kullanmayı öğrenir.
4. Temel düzeyde Matlab öğrenir.

Dersin İçeriği

Dizi verisi inceleme ve hizalama, yapısal veri, genom dizileme, genom analizi, genetik varyasyon, gen ve protein ekspresyonu ve biyolojik ağlar ve yolaklar.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta	Konu	Ön Hazırlık
1)	İleri dizi veri analizi
2)	Dizi hizalama I
3)	Dizi hizalama II
4)	Yapısal veriler
5)	Genom dizileme
6)	Genom analizi I
7)	Genom analizi II
8)	İleri genetik varyasyon analizi I
9)	İleri genetik varyasyon analizi II
10)	Biyolojik ağlar I
11)	Biyolojik ağlar II
12)	Biyolojik yolaklar I
13)	Biyolojik yolaklar II
14)	Biyolojik yolaklar III

Kaynaklar

Ders Notları / Kitaplar:	Ders notları haftalık olarak verilecektir. Course material will be provided weekly.
Diğer Kaynaklar:	Computational Biology Series Editors: Dress, A., Linial, M., Troyanskaya, O., Vingron, M. ISSN: 1568-2684

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl İçi Çalışmaları	Aktivite Sayısı	Katkı Payı
Devam	10	% 10
Sunum	1	% 15
Ara Sınavlar	1	% 25
Final	1	% 50
Toplam		% 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI		% 50
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI		% 50
Toplam		% 100

AKTS / İş Yükü Tablosu

Aktiviteler	Aktivite Sayısı	Süre (Saat)	İş Yükü
Ders Saati	14	4	56
Sınıf Dışı Ders Çalışması	14	7	98
Sunum / Seminer	5	4	20
Ara Sınavlar	1	2	2
Final	1	2	2
Toplam İş Yükü			178

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

Etkisi Yok	1 En Düşük	2 Düşük	3 Orta	4 Yüksek	5 En Yüksek

Dersin Program Kazanımlarına Etkisi

Katkı Payı