BİYOMÜHENDİSLİK (İNGİLİZCE, DOKTORA)
Doktora TYYÇ: 8. Düzey QF-EHEA: 3. Düzey EQF-LLL: 8. Düzey

Ders Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Yarıyıl Teorik Pratik Kredi AKTS
BNG6001 İleri Düzey Hücre Biyolojisi ve Moleküler Yapı Bahar 3 0 3 9
Bu dersin açılması ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir

Temel Bilgiler

Öğretim Dili: En
Dersin Türü:
Dersin Seviyesi: LİSANSÜSTÜ
Dersin Veriliş Şekli: Yüz yüze
Dersin Koordinatörü: Dr. Öğr. Üyesi BURCU TUNÇ ÇAMLIBEL
Dersin Amacı: Bu dersin amacı, hücre biyolojisi ve moleküler yapı bilgilerini mühendislik uygulamalarıyla bütünleştirerek, biyomalzeme tasarımı, doku mühendisliği, biyosensör geliştirme ve ilaç taşıma sistemleri gibi alanlara yönelik biyolojik temelli tasarım becerileri kazandırmaktır. Öğrenciler, hücre içi yapıların işlevlerini, hücre-hücre ve hücre-matris etkileşimlerini ileri düzeyde öğrenerek, bu bilgileri biyomühendislik çözümleri üretmekte kullanabilecek altyapıyı edinirler.

Öğrenme Çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
Dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler:

Hücrenin yapısal ve işlevsel bileşenlerini ileri düzeyde tanımlar.
Hücre sinyalleşmesi, protein etkileşimleri ve gen ekspresyonu mekanizmalarını açıklar.
Hücre–hücre ve hücre–matris etkileşimlerini biyomühendislik bağlamında analiz eder.
Hücresel yapıların biyomalzeme ve doku mühendisliği uygulamalarına etkisini değerlendirir.
Moleküler yapıların karakterizasyonunda kullanılan teknikleri tanır ve karşılaştırır.
Hücresel düzeyde elde edilen bilgileri biyosensör, ilaç taşıma veya yapay doku tasarımı gibi uygulamalara entegre eder.
Disiplinler arası literatürü takip ederek biyomühendislik uygulamaları için bilimsel yorum yapar.

Dersin İçeriği

Bu ders, hücre biyolojisi ve moleküler yapı konularını mühendislik uygulamalarıyla bütünleştirerek biyomühendislik öğrencilerine ileri düzeyde bir perspektif kazandırmayı amaçlar. Hücrenin temel yapısal bileşenleri, sinyal iletimi, protein etkileşimleri, gen ekspresyonu ve hücre dışı matriks yapıları detaylı şekilde ele alınır. Bu biyolojik bilgiler, biyomalzeme tasarımı, doku mühendisliği, biyosensör geliştirme ve ilaç taşıma sistemleri gibi uygulamalara aktarılır. Ayrıca, hücresel ve moleküler yapıların karakterizasyonunda kullanılan modern analiz teknikleri tanıtılır.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Konu Ön Hazırlık
1) Hücresel sistemlere mühendislik bakışı: Tasarımsal biyoloji ve sistemsel yaklaşım
2) Hücre-matris ilişkileri üzerine güncel literatür tartışması ve biyomalzeme tasarımı
3) Hücresel mekanotransdüksiyon: Kuvvet iletimi ve mühendislik uygulamaları
4) Sinyal yollarının mühendislik açısından modellenmesi: MAPK, PI3K/Akt, Wnt örnekleri
5) Hücre-hücre iletişiminin biyosensör teknolojilerine entegrasyonu
6) Moleküler yapılar ve protein mühendisliği: Yapı-temelli tasarım stratejileri
7) Gen düzenleme teknolojilerinin (CRISPR/Cas9) doku mühendisliğindeki rolü
8) Hücre bazlı ilaç tarama sistemleri ve yüksek içerikli görüntüleme yaklaşımları
9) Hücre kültürü sistemlerinin mühendislik temelli optimizasyonu (3D kültür, organoid, mikroakışkanlar)
10) Yapay hücre sistemleri ve biyolojik işlev taklidi: Sentetik biyoloji temelli yaklaşımlar
11) Literatür incelemesi: Hücre biyolojisinin klinik ve tanı teknolojilerine yansıması
12) Öğrenci gruplarıyla vaka tartışmaları: Seçilmiş araştırma makalelerinin teknik analizi
13) Öğrenci sunumları – İleri düzey mühendislik uygulamaları üzerine literatür temelli projeler I
14) Öğrenci sunumları II ve genel tartışma – Yeni araştırma fikirlerinin paylaşımı

Kaynaklar

Ders Notları: Saltzman, W. M. – Biomedical Engineering: Bridging Medicine and Technology, Cambridge University Press Ratner, B. D. et al. – Biomaterials Science: An Introduction to Materials in Medicine, Elsevier Alberts, B. et al. – Molecular Biology of the Cell, Garland Science
Diğer Kaynaklar: Saltzman, W. M. – Biomedical Engineering: Bridging Medicine and Technology, Cambridge University Press Ratner, B. D. et al. – Biomaterials Science: An Introduction to Materials in Medicine, Elsevier Alberts, B. et al. – Molecular Biology of the Cell, Garland Science

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl İçi Çalışmaları Aktivite Sayısı Katkı Payı
Devam 14 % 10
Laboratuar % 0
Uygulama % 0
Arazi Çalışması % 0
Derse Özgü Staj % 0
Küçük Sınavlar % 0
Ödev % 0
Sunum 1 % 20
Projeler % 0
Seminer % 0
Ara Sınavlar 1 % 30
Ara Juri % 0
Final 1 % 40
Rapor Teslimi % 0
Juri % 0
Bütünleme % 0
Toplam % 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI % 60
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI % 40
Toplam % 100

AKTS / İş Yükü Tablosu

Aktiviteler Aktivite Sayısı Süre (Saat) İş Yükü
Ders Saati 14 3 42
Laboratuvar 0 0 0
Uygulama 0 0 0
Derse Özgü Staj 0 0 0
Arazi Çalışması 0 0 0
Sınıf Dışı Ders Çalışması 14 8 112
Sunum / Seminer 1 20 20
Proje 0 0 0
Ödevler 0 0 0
Küçük Sınavlar 0 0 0
Ara Juri 0 0 0
Ara Sınavlar 1 20 20
Rapor Teslimi 0 0 0
Juri 0 0 0
Final 1 30 30
Toplam İş Yükü 224

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

Etkisi Yok 1 En Düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 En Yüksek
           
Dersin Program Kazanımlarına Etkisi Katkı Payı
1) Bilimsel literatürü takip eder, eleştirel biçimde analiz eder ve mühendislik problemlerinin çözümünde etkin biçimde kullanır. 5
2) Biyomühendislik alanında bilimsel yenilikçi tasarımlar için doğru soruları sorar, yenilikçi çalışmayı planlar, uygular, yönetir, dokümante eder.
3) Biyomühendislik ile ilgili, alanındaki çalışmaları bağımsız olarak yürütür, derinlemesine inceler, sorumluluk alır ve elde edilen sonuçları eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirir.
4) Yaptığı araştırma ve projelerin sonuçlarını akademik standartlara uygun biçimde yazılı, sözlü ve görsel olarak etkili bir şekilde sunar.
5) Biyomühendislik ile ilgili derin uzmanlık gerektiren konularda bağımsız araştırma yapar, özgün düşünce geliştirir ve bu bilgileri uygulamaya aktarır. 5
6) Biyomühendisliğe özgü ileri düzey kuramsal ve uygulamalı bilgileri etkin bir biçimde kullanır. 4
7) Mesleki, bilimsel ve etik değerlere uygun hareket eder; mühendislik uygulamalarının toplumsal, çevresel ve etik etkilerini gözeterek sorumluluk alır.