ENDÜSTRİ 4.0 (İNGİLİZCE, TEZSİZ)
Yüksek Lisans TYYÇ: 7. Düzey QF-EHEA: 2. Düzey EQF-LLL: 7. Düzey

Ders Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Yarıyıl Teorik Pratik Kredi AKTS
MED3029 İlaç Reseptör Etkileşimlerini Anlamak Güz 2 0 2 2
Bu dersin açılması ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir

Temel Bilgiler

Öğretim Dili: En
Dersin Türü: Departmental Elective
Dersin Seviyesi: LİSANSÜSTÜ
Dersin Veriliş Şekli: Yüz yüze
Dersin Koordinatörü: Prof. Dr. SERDAR DURDAĞI
Dersin Amacı: Ilac-reseptor etkilesimlerinde matematiksel ve kuantum kimyasal temellerin doğru bir şekilde sunulması amaçlanmaktadır. Hesaplamalı kimya metodlarına ait uygulamaların mevcut bilgisayar programları ile yapılması hedeflenmektedir.

Öğrenme Çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
1. Ogrencilerin kisisel bilgisayarlarinda verilen bir protein-ligand sistemi icin molekuler kenetlenme ve molkuler dinamik (MD) programlarinda simulasyonu hazir hale getirebilmesi ve calistirabilmesi
2. Temel docking ve MD analizlerini (trajectori) yapabilmesi ve sonuclari yorumlayabilmesi
3. Sanal tarama yontemlerini anlamak ve uygulayabilmek

Dersin İçeriği

1. Molekuler Kenetlenme Simulasyonlarina giris (teori)
2. Molekuler Kenetlenme Simulasyonlarina giris (uygulama)
3. Ilac/Reseptor sistemleri icin MD simulayonlarina giris-1 (teori)
4. Ilac/Reseptor sistemleri icin MD simulayonlarina giris-2 (teori)
5. MD simulasyon (uygulama)
6. MD simulayon (uygulama)
7. MD sonrasi analizler (teori)
8. MD sonrasi analizler (uygulama)
9. Ogrenci projeleri-1
10. Ogrenci projeleri-2
11. Ogrenci projeleri-3

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Konu Ön Hazırlık

Kaynaklar

Ders Notları: Molecular Modelling: Principles and Applications, by Andrew Leach http://www.amazon.com/Molecular-Modelling-Applications-Andrew-Leach/dp/0582239338 Molecular Modeling and Simulation, by Tamar Schlick http://www.amazon.com/Molecular-Modeling-Simulation-Tamar-Schlick/dp/038795404X
Diğer Kaynaklar: Introduction to Protein Structure: Second Edition, by Carl Branden and John Tooze http://www.amazon.com/Introduction-Protein-Structure-Carl-Branden/dp/0815323050

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl İçi Çalışmaları Aktivite Sayısı Katkı Payı
Devam % 0
Laboratuar % 0
Uygulama % 0
Arazi Çalışması % 0
Derse Özgü Staj % 0
Küçük Sınavlar % 0
Ödev % 0
Sunum % 0
Projeler % 0
Seminer % 0
Ara Sınavlar % 0
Ara Juri % 0
Final % 0
Rapor Teslimi % 0
Juri % 0
Bütünleme % 0
Toplam % 0
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI % 0
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI % 0
Toplam % 0

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

Etkisi Yok 1 En Düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 En Yüksek
           
Dersin Program Kazanımlarına Etkisi Katkı Payı