| ENDÜSTRİ 4.0 (İNGİLİZCE, TEZSİZ) | |||||
| Yüksek Lisans | TYYÇ: 7. Düzey | QF-EHEA: 2. Düzey | EQF-LLL: 7. Düzey | ||
| Ders Kodu | Ders Adı | Yarıyıl | Teorik | Pratik | Kredi | AKTS |
| MED2017 | Moleküler Modelleme ve Simulasyonlara Giriş | Güz | 2 | 2 | 2 | 2 |
| Bu dersin açılması ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir |
| Öğretim Dili: | En |
| Dersin Türü: | Departmental Elective |
| Dersin Seviyesi: | LİSANSÜSTÜ |
| Dersin Veriliş Şekli: | Yüz yüze |
| Dersin Koordinatörü: | Prof. Dr. SERDAR DURDAĞI |
| Dersi Veren(ler): |
Prof. Dr. SERDAR DURDAĞI |
| Dersin Amacı: | Moleküler modellemedeki matematiksel ve kuantum kimyasal temellerin doğru bir şekilde sunulması amaçlanmaktadır. Hesaplamalı kimya metodlarına ait uygulamaların mevcut bilgisayar programları ile yapılması hedeflenmektedir. |
|
Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler; 1. Protein yapisi, 3D-QSAR, molekuler kenetlenme, molekuler dinamik (MD) simulasyonlar, ve bilgisayar-destekli ilac tasarimi konularinda temel prensiplerin anlasilmasi 2. Ogrencilerin kisisel bilgisayarlarinda bir protein veya herhangi bir biyomolekuler sistem icin MD simulasyon islemlerini hazirlayabilmesi ve calistirabilmesi 3. Temel MD analizlerini (trajectori) yapabilmesi ve sonuclari yorumlayabilmesi 4. Sanal tarama yontemlerini anlamak ve uygulayabilmek |
| 1. Protein yapisi ve goruntulemesine giris 2. Ligand ve yapi-bazli ilac tasarim tekniklerine giris 3. 3D-QSAR (teori) 4. 3D-QSAR (uygulama) 5. Molekuler Kenetlenme Simulasyonlarina giris (teori) 6. Molekuler Kenetlenme Simulasyonlarina giris (uygulama) 7. MD simulayonlarina giris-1 (teori) 8. MD simulayonlarina giris-2 (teori) 9. MD simulayonlarina giris (uygulama) 10. MD simulayonlarina giris (uygulama) 11. MD sonrasi analizler (teori) 12. MD sonrasi analizler (uygulama) 13. Ogrenci projeleri-1 14. Ogrenci projeleri-2 |
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık |
| Ders Notları: | Molecular Modelling: Principles and Applications, by Andrew Leach http://www.amazon.com/Molecular-Modelling-Applications-Andrew-Leach/dp/0582239338 Molecular Modeling and Simulation, by Tamar Schlick http://www.amazon.com/Molecular-Modeling-Simulation-Tamar-Schlick/dp/038795404X |
| Diğer Kaynaklar: | Introduction to Protein Structure: Second Edition, by Carl Branden and John Tooze http://www.amazon.com/Introduction-Protein-Structure-Carl-Branden/dp/0815323050 |
| Yarıyıl İçi Çalışmaları | Aktivite Sayısı | Katkı Payı |
| Devam | % 0 | |
| Laboratuar | % 0 | |
| Uygulama | % 0 | |
| Arazi Çalışması | % 0 | |
| Derse Özgü Staj | % 0 | |
| Küçük Sınavlar | % 0 | |
| Ödev | % 0 | |
| Sunum | % 0 | |
| Projeler | % 0 | |
| Seminer | % 0 | |
| Ara Sınavlar | % 0 | |
| Ara Juri | % 0 | |
| Final | % 0 | |
| Rapor Teslimi | % 0 | |
| Juri | % 0 | |
| Bütünleme | % 0 | |
| Toplam | % 0 | |
| YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI | % 0 | |
| YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI | % 0 | |
| Toplam | % 0 | |
| Etkisi Yok | 1 En Düşük | 2 Düşük | 3 Orta | 4 Yüksek | 5 En Yüksek |
| Dersin Program Kazanımlarına Etkisi | Katkı Payı |