ENDÜSTRİ 4.0 (İNGİLİZCE, TEZSİZ)
Yüksek Lisans TYYÇ: 7. Düzey QF-EHEA: 2. Düzey EQF-LLL: 7. Düzey

Ders Tanıtım Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Yarıyıl Teorik Pratik Kredi AKTS
KİM3061 Biyokimya Güz 2 0 2 3
Bu dersin açılması ilgili bölüm tarafından yarıyıl başında belirlenir

Temel Bilgiler

Öğretim Dili: Tr
Dersin Türü: Departmental Elective
Dersin Seviyesi: LİSANSÜSTÜ
Dersin Veriliş Şekli: Yüz yüze
Dersin Koordinatörü: Dr. Öğr. Üyesi ÖMER LÜTFİ UYANIK
Dersin Amacı: Bu ders birçok bilimsel çalışma alanı için yararlı bir altyapı oluşturmak üzere tasarlanmıştır. Ders konuları canlı sistemlerin organik yapıları ve temel ilkeler ve uygulamaları kapsamaktadır.
Ders amacı ileri biyokimya konularında çalışmalar yapmak isteyen öğrenciler için yeterli bir altyapı oluşturmak ve bilgiyi eleştirel olarak değerlendirmek ve bilimsel düşünme yeteneğini geliştirmektir.

Öğrenme Çıktıları

Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
Bu derste başarılı olan öğrenciler;
1) biyokimya alanında temel bilgiye sahip olacak,
2) bilimsel literatürü araştırıp, anlayıp alıntılayabilecek,
3)polimerik biyomoleküllerin beş sınıfını ve bunların monomerik yapısal ünitelerini belirleyebilecek,
4)enzimatik bir reaksiyonda, enzimlerin biyokimyasal katalizör olarak özgünlüklerini açıklayabilecek,
5)glukoz metabolisması sonucunda yüksek miktarda ATP oluşumunun açıklayabilecek,
6)DNA yapısının tanımlanması ve temel tekrarlanan üniteler üzerinde genetik bilginin ne şekilde taşındığının açıklayabilecek,
7)DNA kopyalanmasını tanımlayabilecek,
8)RNA ve protein sentezini tanımlayabilecek,
9)Transkripsiyon ve kalıt okuma seviyesinde protein sentezini açıklayabileceklerdir.

Dersin İçeriği

Karbonhidratlar, lipidler, amino asitler, nükleik asitler, gen tanımı ve kopyalanması, RNA sentezi, protein sentezi, DNA kopyalanması, moleküler klonlama, polipeptidlerin kimyasal sentezi, proteinlerin kovalent yapıları, enzimler, bioenerjetikler, metabolizma ve ATP enerjisi, besinlerin sindirimi, karbonhidrat metabolizması.

Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği

Hafta Konu Ön Hazırlık
1) Fonksiyonel Gruplar ve Alifatik ve Aromatik Bileşikleri içeren organik bileşiklerin IUPAC adlandırması Problem çözümü ile organik kimyaya genel bir bakış Konu tekrarı
2) Karbonhidratlar; Monosakkaritler, Kiral Karbon Atomları, Enantiomerler, Monosakkaritlerde halkalı yapı, Çevirme Açısı, Galaktozun halkalı yapıları, Fruktozun halkalı yapıları, Monosakkaritlerin yükseltgenmesi, Disakkaritler, Glikozitler, Maltoz, Laktoz, Sukroz, Fermantasyon, Öğrenci projelerinin araştırma konularının tayini Konu tekrarı
3) Polisakkaritler, Amiloz, Amilopektin, Glikojen, Selüloz, Yağlar, Yağ asitleri, Yağ asitlerinin fiziksel özelikleri, Vakslar, katı ve sıvı yağlar, Sıvı yağlar ve katı yağların erime noktası Laboratuvarda gerçekleştirilecek deney projelerinin tanıtımı. Konu tekrarı
4) Aminoasitlerin yapısı, Apolar yan zincirlere sahip aminoasitler, Yüksüz polar yan zincirlere sahip aminoasitler, Yüklü polar yan zincirlere sahip aminoasitler, Peptit bağları, Sınıflandırma ve özellikler. Konu tekrarı
5) Asit - baz özellikleri, Terminoloji, Aminoasitlerde optik aktivite; İşlevsel sınıflandırma, Fischer Konvensiyonu, Cahn-Ingold-Prelog Sistemi, Şirallik, Standart olmayan aminoasitler. Konu tekrarı
6) Nükleotidler ve nükleik asitler, DNA ve RNA ‘nın kimyasal yapısı Konu tekrarı
7) Genetik bilgi taşıyıcısı olarak DNA, Transformasyon İlkesi, Bazı bakteriyofajların kalıtsal molekülü, DNA’nın çift sarmal yapısı, B-DNA’nın Watson-Crick yapısı Konu tekrarı
8) DNA’nın yarı korunarak kopyalanması , Denatürasyon ve renatürasyon, DNA’nın büyüklüğü, Gen ifadesi ve kopyalama. Konu tekrarı
9) RNA Sentezi: Transkripsiyon, Protein sentezi: Translasyon, DNA Replikasyonu, Molekuler klonlama. Konu tekrarı
10) Polipeptitlerin kimyasal sentezi, Proteinlerin kovalent yapısı: Birincil yapı, Proteinlerin üç boyutlu yapısı, İkincil yapı. Konu tekrarı
11) İpliksi proteinler, Küre biçiminde proteinler: Üçüncül yapı, Dördüncül yapı, Enzimler, Substratların spesifikliği, Koenzimler, enzimatik aktivitenin düzenlenmesi, reaksiyon tipine göre enzimlerin sınıflandırılması. Konu tekrarı
12) Bioenerji Bilimi, Metabolizma ve ATP Enerjisi, Besinlerin Sindirimi. Araştırma projesi teslimi Konu tekrarı
13) Metabolik yollarda önemli koenzimler: Redoks reaksiyonları, Glikoliz: Glikozun yükseltgenmesi, Glikozizdeki reaksiyonlar. Konu tekrarı
14) Sitrik asit döngüsü (TCA döngüsü), Elektron iletim zinciri, Kemiozmotik model: Oksidatif fosforilasyon. Karbohidrat mekanizmasının diğer yolları: Gliksolat döngüsü. Deneysel projelerin teslimi Konu tekrarı

Kaynaklar

Ders Notları: 1) Harper Biyokimya, Çeviri kitap, Nurten DİKMEN, Tuncay ÖZGÜNEN. 2) Chemistry, An introduction to General, Organic, & Biological Chemistry, K.C. Timberlake, 7th Ed.,1999.
Diğer Kaynaklar: 1) Biochemistry, D. Voet, J. G. Voet, 3rd Ed., John Wiley & Sons, USA., 2004. 2) Biochemistry: the Molecular Basis of Life, T. McKee and J. R. McKee. 3rd Ed. WCB/McGraw-Hill Press, Boston, MA 2003. 3) Principles of Biochemistry, D. L. Nelson & M. M. Cox, , 4th Ed., Worth Publishers, USA., 2005 4) Biochemistry, G. L. Zubay, 4th Ed., Mc Graw Hill, USA., 1998. 5) Kolay Biyokimya Sağlık Bilimleri için Temel Rehber Paul Engel.

Değerlendirme Sistemi

Yarıyıl İçi Çalışmaları Aktivite Sayısı Katkı Payı
Devam % 0
Laboratuar % 0
Uygulama % 0
Arazi Çalışması % 0
Derse Özgü Staj % 0
Küçük Sınavlar % 0
Ödev % 0
Sunum 1 % 20
Projeler 1 % 20
Seminer % 0
Ara Sınavlar 1 % 20
Ara Juri % 0
Final 1 % 40
Rapor Teslimi % 0
Juri % 0
Bütünleme % 0
Toplam % 100
YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTU KATKISI % 40
YARIYIL SONU ÇALIŞMALARININ BAŞARI NOTUNA KATKISI % 60
Toplam % 100

AKTS / İş Yükü Tablosu

Aktiviteler Aktivite Sayısı Süre (Saat) İş Yükü
Ders Saati 14 3 42
Laboratuvar 0 0 0
Uygulama 0 0 0
Derse Özgü Staj 0 0 0
Arazi Çalışması 0 0 0
Sınıf Dışı Ders Çalışması 14 1 14
Sunum / Seminer 1 1 1
Proje 1 2 2
Ödevler 0 0 0
Küçük Sınavlar 0 0 0
Ara Juri 0
Ara Sınavlar 1 6 6
Rapor Teslimi 0
Juri 0
Final 1 10 10
Toplam İş Yükü 75

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

Etkisi Yok 1 En Düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 En Yüksek
           
Dersin Program Kazanımlarına Etkisi Katkı Payı